90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0948 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  98.93 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  98.93 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  80.75 
 
 		 197 aa  320  8e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  54.35 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  56.67 
 
 		 201 aa  201  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  49.16 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  45.71 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  45.71 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  98.65 
 
 		 74 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  58.59 
 
 		 148 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  40.22 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  44.57 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  93.24 
 
 		 74 aa  141  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  40.46 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  39.06 
 
 		 229 aa  131  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  38.54 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  36.7 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  35.08 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  43.26 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  39.34 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  39.34 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  35.09 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  39.34 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  36.63 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  38.25 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  37.7 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  36.09 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  35.5 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  35.16 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  33.53 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  43.26 
 
 		 192 aa  112  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  37.7 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  43.07 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  37.57 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  37.57 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  31.46 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  37.16 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  41.61 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  43.8 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  42.47 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  42.34 
 
 		 195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  31.46 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  36.32 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  33.53 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  34.78 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  34.78 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  34.57 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  33.51 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  33.68 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  41.79 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  39.71 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  31.75 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  39.23 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  39.55 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  38.57 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  30.69 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  31.22 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  40.15 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  31.49 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  38.35 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  34.48 
 
 		 190 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  30.77 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  41.04 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  35.5 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  36.3 
 
 		 193 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  35.34 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  30.27 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  31.55 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  34.88 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  33.33 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  37.5 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  29.01 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  38.1 
 
 		 63 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  33.59 
 
 		 476 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  35.44 
 
 		 484 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  35.44 
 
 		 484 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.23 
 
 		 475 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  41.79 
 
 		 126 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  24.65 
 
 		 551 aa  45.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  31.73 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  26 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  29.71 
 
 		 343 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 		 474 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  30.84 
 
 		 195 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>