49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2258 on replicon NC_010579
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
74 aa  150  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  94.59 
 
 
74 aa  141  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  93.24 
 
 
209 aa  141  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  93.24 
 
 
215 aa  140  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  93.24 
 
 
215 aa  140  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  81.08 
 
 
197 aa  124  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  58.21 
 
 
201 aa  87  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  55.56 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  56.45 
 
 
201 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  53.23 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  53.23 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  51.79 
 
 
201 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  43.48 
 
 
216 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  42.03 
 
 
216 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  42.03 
 
 
216 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  42.03 
 
 
216 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  42.03 
 
 
216 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 
216 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  39.34 
 
 
194 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  42.03 
 
 
244 aa  54.7  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  39.13 
 
 
229 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  40.98 
 
 
193 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  40.98 
 
 
201 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  39.13 
 
 
229 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  40.98 
 
 
192 aa  50.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  42.62 
 
 
192 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  42.62 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  40.98 
 
 
195 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  36.23 
 
 
229 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  31.94 
 
 
222 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  32.88 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  34.25 
 
 
219 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  37.29 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  30.99 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  37.29 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  27.78 
 
 
208 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  34.29 
 
 
195 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  32.2 
 
 
196 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  36.84 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  36.21 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  37.29 
 
 
195 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  36.07 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  37.5 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  33.8 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  36.67 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  27.78 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  39.29 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  38.18 
 
 
207 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  32.79 
 
 
193 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>