80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12805 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  100 
 
 
193 aa  384  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  81.96 
 
 
194 aa  308  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  86.44 
 
 
202 aa  306  9e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  80.33 
 
 
203 aa  292  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  74.58 
 
 
190 aa  258  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  75.44 
 
 
190 aa  252  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  75.44 
 
 
190 aa  252  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  70.18 
 
 
197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  70.37 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  59.07 
 
 
193 aa  218  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  70.93 
 
 
295 aa  209  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  55.74 
 
 
195 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  54.21 
 
 
196 aa  207  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  74.13 
 
 
162 aa  197  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  47.69 
 
 
197 aa  174  8e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  76.84 
 
 
116 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  35.6 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  51.67 
 
 
126 aa  104  8e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  42.21 
 
 
229 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  31.82 
 
 
215 aa  101  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  42.58 
 
 
229 aa  101  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  39.01 
 
 
206 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  39.01 
 
 
206 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  31.82 
 
 
213 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  31.82 
 
 
213 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  34 
 
 
222 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  41.94 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  39.55 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  41.35 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  41.35 
 
 
192 aa  94.7  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  38.81 
 
 
215 aa  94.4  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  38.81 
 
 
215 aa  94.4  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 
197 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  39.85 
 
 
195 aa  92.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  35.66 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  38.35 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  31.55 
 
 
219 aa  89  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  60.71 
 
 
147 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  34.11 
 
 
222 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  32 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  38.81 
 
 
193 aa  87  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  34.62 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  32.88 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  32 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  30.6 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  33.33 
 
 
222 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  33.16 
 
 
208 aa  84.3  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  31.35 
 
 
209 aa  84.3  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  63.93 
 
 
81 aa  83.6  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  32.29 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  35.52 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  34.97 
 
 
219 aa  81.3  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  37.78 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  32.14 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  30 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  38.73 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  32.12 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  32.43 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  28.11 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  36.62 
 
 
216 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  37.32 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  38.35 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  37.32 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  37.32 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  29.05 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  29.05 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  35.21 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  35.21 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  26.73 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  29.93 
 
 
201 aa  61.2  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  72.5 
 
 
132 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  32.12 
 
 
148 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  64.44 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  22.47 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  38.6 
 
 
74 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 
74 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>