81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2683 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  100 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  84.12 
 
 		 190 aa  291  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  84.12 
 
 		 190 aa  291  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  81.05 
 
 		 197 aa  276  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  74.72 
 
 		 193 aa  259  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  71.43 
 
 		 194 aa  253  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  72.13 
 
 		 203 aa  249  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  72.32 
 
 		 202 aa  248  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  74.53 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  59.56 
 
 		 195 aa  221  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  78.53 
 
 		 162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  62.37 
 
 		 193 aa  214  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  57.61 
 
 		 196 aa  207  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  65.12 
 
 		 295 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  49.21 
 
 		 197 aa  177  5.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  82.11 
 
 		 116 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  35.26 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  94.64 
 
 		 249 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  37.68 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  38.12 
 
 		 229 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  50.83 
 
 		 126 aa  105  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  38.92 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  35.83 
 
 		 222 aa  104  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  33.89 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  33.89 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  30.48 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  30.48 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  69.05 
 
 		 147 aa  101  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  34 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  34 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  31.77 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  34.57 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  30.85 
 
 		 219 aa  94.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  30.6 
 
 		 208 aa  94.7  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  34.83 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  33.51 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  34.27 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  29.44 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  35.71 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  31.49 
 
 		 209 aa  88.2  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  35.27 
 
 		 219 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  32.58 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  35.58 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  34.92 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  28.89 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  31.75 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  34.72 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  31.67 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  35.96 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  35.39 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  31.32 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  63.49 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  34.83 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  32.81 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  35.39 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  31.05 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  34.83 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  34.83 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  32.28 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  32.29 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  27.89 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  32.29 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  32.14 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  28.8 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  31.38 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  34.27 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  28.34 
 
 		 203 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  28.34 
 
 		 203 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  27.66 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  29.19 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  32.35 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  68.63 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  31.91 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  24.87 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  40 
 
 		 74 aa  48.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  38.57 
 
 		 74 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0464  regulatory protein MerR  26.39 
 
 		 100 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.169334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>