284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1467 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  100 
 
 		 551 aa  1153    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  63.12 
 
 		 550 aa  724    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  43.18 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  39.22 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  39.31 
 
 		 612 aa  384  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  54.26 
 
 		 274 aa  291  2e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  29.74 
 
 		 541 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  28.36 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  26.83 
 
 		 537 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.73 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  26.99 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26.89 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.29 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  24.18 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.71 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.58 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.15 
 
 		 522 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  23.28 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.36 
 
 		 515 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  25 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  25 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.88 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.74 
 
 		 586 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.83 
 
 		 415 aa  103  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  24.72 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.19 
 
 		 534 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.56 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  24.54 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.85 
 
 		 429 aa  94  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  23.27 
 
 		 516 aa  94  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 548 aa  94  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.74 
 
 		 484 aa  94  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.74 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.27 
 
 		 516 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.31 
 
 		 534 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.31 
 
 		 537 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.31 
 
 		 534 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.8 
 
 		 542 aa  92  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.8 
 
 		 554 aa  92  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.31 
 
 		 534 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.31 
 
 		 534 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.79 
 
 		 525 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  21.09 
 
 		 519 aa  91.3  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.19 
 
 		 540 aa  91.3  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.38 
 
 		 524 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  21.86 
 
 		 511 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.06 
 
 		 534 aa  91.3  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  24.41 
 
 		 576 aa  90.9  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.26 
 
 		 447 aa  90.5  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25.34 
 
 		 541 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.01 
 
 		 528 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.27 
 
 		 528 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.3 
 
 		 613 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  23.85 
 
 		 590 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  27.16 
 
 		 517 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  22.86 
 
 		 525 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  22.83 
 
 		 462 aa  88.2  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  21.96 
 
 		 523 aa  87.4  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.57 
 
 		 523 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.1 
 
 		 540 aa  87  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  23.14 
 
 		 491 aa  87  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.68 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  23.14 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  24.21 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.68 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  23.08 
 
 		 515 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  23.95 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  22.14 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.39 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  23.06 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.05 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  22.79 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  23.11 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.17 
 
 		 561 aa  84.7  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  25.24 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  23.09 
 
 		 558 aa  84  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  22.76 
 
 		 534 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  23.2 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25.05 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  21.99 
 
 		 506 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  22.73 
 
 		 527 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  23.67 
 
 		 522 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.27 
 
 		 506 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  23.7 
 
 		 504 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  21.35 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.06 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.85 
 
 		 565 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  23.95 
 
 		 546 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  23.32 
 
 		 515 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.15 
 
 		 665 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  22.81 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.33 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  28.83 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  23.83 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  23.12 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  22.31 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0025  resolvase  23.64 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.712822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  25.66 
 
 		 540 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  21.58 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  24.51 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>