145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3670 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
201 aa  406  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  56.22 
 
 
201 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  56.22 
 
 
215 aa  235  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  56.22 
 
 
215 aa  235  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  59.04 
 
 
197 aa  227  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  56.67 
 
 
209 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  51.01 
 
 
203 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  51.01 
 
 
203 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  48.76 
 
 
201 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  52.55 
 
 
219 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  55.86 
 
 
148 aa  154  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  41.84 
 
 
201 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  36.18 
 
 
205 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  35.68 
 
 
205 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  39.27 
 
 
195 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  36.32 
 
 
229 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  35.82 
 
 
229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  39.79 
 
 
195 aa  144  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  35.32 
 
 
229 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  39.15 
 
 
197 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  39.57 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  37.75 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  37.75 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  37.75 
 
 
215 aa  138  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  39.38 
 
 
202 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  37.81 
 
 
216 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  37.06 
 
 
209 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  37.31 
 
 
216 aa  134  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  37.81 
 
 
216 aa  134  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  37.81 
 
 
216 aa  134  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  38.31 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  35.64 
 
 
244 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  36.14 
 
 
216 aa  128  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  37.06 
 
 
194 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  34.93 
 
 
219 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  36.32 
 
 
216 aa  123  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  36.87 
 
 
192 aa  121  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.05 
 
 
208 aa  121  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  34.13 
 
 
219 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  36.87 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  36.87 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  36.6 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  34.52 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  34.52 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  36.51 
 
 
222 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  36.08 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  36.51 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  32.09 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  34.85 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  35.35 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  34.2 
 
 
207 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  34.85 
 
 
191 aa  102  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  30.46 
 
 
206 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  30.46 
 
 
206 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  38.13 
 
 
196 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  32.57 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  31.35 
 
 
190 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  39.1 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  59.7 
 
 
74 aa  92  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  31.82 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  32 
 
 
202 aa  89  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  30.21 
 
 
197 aa  87.8  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 
190 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 
190 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  58.21 
 
 
74 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  29.05 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  29.1 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  29.35 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  29.55 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  26.63 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  54.55 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  37.97 
 
 
128 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  28.4 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  52.27 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  28.43 
 
 
116 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  54.55 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  51.28 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  42.86 
 
 
94 aa  48.9  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  43.64 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  51.22 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  40 
 
 
76 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  41.07 
 
 
75 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  42.11 
 
 
707 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  48.98 
 
 
71 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  48 
 
 
67 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  44.44 
 
 
67 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  44.44 
 
 
68 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 
67 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 
67 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 
68 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  44.23 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  38.89 
 
 
72 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 
67 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.401166 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>