98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0754 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  45.45 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  44.85 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  41.29 
 
 
222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  42.41 
 
 
229 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  41.36 
 
 
229 aa  151  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  40.31 
 
 
229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  37.24 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  38.97 
 
 
215 aa  132  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  37.76 
 
 
194 aa  132  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  39.49 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  38.27 
 
 
192 aa  128  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  35.35 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  35.35 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  38.46 
 
 
192 aa  125  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  38.46 
 
 
193 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  38.97 
 
 
192 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  38.42 
 
 
201 aa  125  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  36.92 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  33.17 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  34.93 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  34.93 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  33.67 
 
 
219 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  33.17 
 
 
222 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  33.17 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  33.67 
 
 
219 aa  114  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  33.01 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  37.14 
 
 
197 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  36 
 
 
202 aa  111  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  33.84 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  37.64 
 
 
195 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  38.2 
 
 
195 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 
216 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 
216 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  34.21 
 
 
244 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  36.92 
 
 
191 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  34.83 
 
 
197 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  31.53 
 
 
208 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  34.57 
 
 
209 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  37.79 
 
 
207 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  34.39 
 
 
216 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  31.91 
 
 
204 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  30.48 
 
 
208 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  34.39 
 
 
216 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
216 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
216 aa  101  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  34.87 
 
 
219 aa  101  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  31.91 
 
 
195 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  38.13 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  31.28 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  31.28 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  33.9 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  33.9 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  32.52 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  32.62 
 
 
196 aa  91.7  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  34.2 
 
 
201 aa  91.7  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  31.14 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  31.14 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  38.46 
 
 
148 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  33.58 
 
 
193 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  30.77 
 
 
190 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  28.37 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  30.34 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  27.07 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  29.59 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  28.65 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  29.37 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 
182 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  28.32 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  44.19 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0727  transposon resolvase  46.77 
 
 
87 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  29 
 
 
116 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  28.83 
 
 
295 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  26.49 
 
 
205 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  40 
 
 
63 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  25.95 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  34.15 
 
 
462 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  26.43 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  23.19 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  23.19 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  23.19 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3707  site-specific recombinase, resolvase family  25.71 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000349891 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3445  site-specific recombinase  25.71 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3396  site-specific recombinase  25.71 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  23.19 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  30.86 
 
 
504 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  25.71 
 
 
218 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3480  resolvase family site-specific recombinase  25.71 
 
 
218 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
218 aa  45.1  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.98 
 
 
515 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4123  OrfB family transposase  53.66 
 
 
121 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00660809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  30.68 
 
 
565 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 
590 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0072  transposase  48.65 
 
 
50 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.905697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.77 
 
 
551 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
323 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>