87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0465 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  81.76 
 
 		 148 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  52.38 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  52.38 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  54.4 
 
 		 197 aa  211  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  54.35 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  48.73 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  52.55 
 
 		 201 aa  184  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  43.22 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  43.22 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  36.55 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  40.91 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  37.37 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  36.87 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  37.88 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  33.68 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  35 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  35.71 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  35 
 
 		 195 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  34.39 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  32.12 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  31.61 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  33.67 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  34.72 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  33.8 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  32.87 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  33.64 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  33.8 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  34.22 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  32.68 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  33.02 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  32.99 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  35.6 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  32.99 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  32.68 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  33.82 
 
 		 209 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  34.87 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  36.81 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  31.03 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  32.23 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  32.28 
 
 		 196 aa  99  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  30.65 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  36.87 
 
 		 194 aa  98.6  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  35.24 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  35.24 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  33.17 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  32.24 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  36.11 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  37.08 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  36.11 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  32.4 
 
 		 195 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  31.15 
 
 		 190 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  32.42 
 
 		 195 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  33.89 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  35.16 
 
 		 193 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  35.71 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  31.11 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  31.11 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  29.47 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  31.18 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  33.14 
 
 		 197 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  31.62 
 
 		 194 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  32.59 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  51.43 
 
 		 74 aa  80.5  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  55.56 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  25.84 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  27.23 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  25.73 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  26.89 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  28.24 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  29.67 
 
 		 116 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  37.21 
 
 		 63 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  38.18 
 
 		 81 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  25 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  29.13 
 
 		 295 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  37.5 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  40.62 
 
 		 94 aa  43.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1612  putative transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 351 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  46.34 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 244 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  24.1 
 
 		 579 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>