79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5986 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  315  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  83.92 
 
 		 182 aa  229  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  79.87 
 
 		 190 aa  226  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  81.12 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  81.12 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  70.62 
 
 		 194 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  77.62 
 
 		 197 aa  210  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  73.51 
 
 		 193 aa  207  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  70.67 
 
 		 202 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  69.23 
 
 		 203 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  62.42 
 
 		 195 aa  188  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  60.38 
 
 		 193 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  58.71 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  50.61 
 
 		 197 aa  150  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  64.83 
 
 		 295 aa  147  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  78.95 
 
 		 116 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  41.04 
 
 		 222 aa  95.5  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  35.44 
 
 		 204 aa  95.1  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  70.27 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  42.07 
 
 		 229 aa  93.6  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 229 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  33.57 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  33.57 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  41.38 
 
 		 229 aa  90.9  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  31.06 
 
 		 208 aa  87.4  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  86.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  33.59 
 
 		 222 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  36.43 
 
 		 202 aa  84  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  34.93 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  32.03 
 
 		 222 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  31.25 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  34.25 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  34.25 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  36.3 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  32.87 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  31.25 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  62.9 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  37.9 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  47.31 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  35.56 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  34.64 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  35.82 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  33.92 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  36.29 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  35.34 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  38.58 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  35.48 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  34.59 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  31.65 
 
 		 212 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  30.53 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  29.08 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  37.01 
 
 		 216 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  34.68 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  36.22 
 
 		 216 aa  70.5  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  34.56 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  37.01 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  37.01 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  31.34 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  72.55 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  33.82 
 
 		 208 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  28.06 
 
 		 201 aa  67  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  27.54 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  34.4 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  36.51 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  30.94 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  27.14 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  35.43 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  33.59 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  26.62 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  26.62 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  25 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  34.13 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  36.14 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  33.71 
 
 		 196 aa  51.2  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  37.14 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  23.33 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  23.33 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>