71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2776 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  100 
 
 		 116 aa  227  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  81.19 
 
 		 190 aa  163  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  85.26 
 
 		 197 aa  163  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  75.49 
 
 		 193 aa  159  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  68.42 
 
 		 194 aa  158  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  81.05 
 
 		 190 aa  157  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  81.05 
 
 		 190 aa  157  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  76.84 
 
 		 182 aa  151  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  71.29 
 
 		 202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  78.72 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  66.36 
 
 		 203 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  63.11 
 
 		 195 aa  135  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  63.46 
 
 		 197 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  59.13 
 
 		 193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  60 
 
 		 196 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  61.46 
 
 		 295 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  68.49 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  62.12 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  40 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  34.29 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  35.24 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  32.5 
 
 		 209 aa  67.4  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  29.41 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  33.96 
 
 		 192 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  31.67 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  31.67 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  28.95 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  28.95 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  37.86 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  32.38 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  70.59 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  30.39 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  38.68 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  27.73 
 
 		 222 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  26.89 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  27.73 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  39.42 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  31.78 
 
 		 193 aa  62  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  31.78 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  35.42 
 
 		 202 aa  62  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  26.05 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  32.11 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  30.56 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  33 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  33 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  29.29 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  34.02 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 215 aa  57  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  28.97 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  39.78 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  34.02 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  32.38 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  34.69 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  33.04 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  37.63 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  29.41 
 
 		 209 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  36.56 
 
 		 216 aa  53.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  28.97 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  36.56 
 
 		 244 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  28.97 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  34.04 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  36.56 
 
 		 216 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  36.56 
 
 		 216 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  26.47 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  36.56 
 
 		 216 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  27.19 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 201 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  51.16 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  35.29 
 
 		 74 aa  40  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>