112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1612 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1612  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 351 aa  682    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4927  MerR family transcriptional regulator  40.9 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  38.63 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4437  regulatory protein, MerR  42.68 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  36.53 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  37.2 
 
 		 287 aa  95.9  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3056  transcriptional regulator, MerR family  53.75 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2587  transcriptional regulator, MerR family  54.17 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0686  transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.162378  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0637  transcriptional regulator, MerR family  47.3 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 245 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0738  putative transcriptional regulator, MerR family  57.14 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.878352  normal  0.260492 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  48.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  48.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  48.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  48.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  48.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  48.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28680  predicted transcriptional regulator  49.43 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  25.1 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  23.4 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 242 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  28.69 
 
 		 242 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  28.69 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 345 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  24.13 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  38.98 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  50.7 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 247 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 305 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 293 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  33.77 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  33.77 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  33.77 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  33.77 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 243 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 243 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  37.7 
 
 		 243 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  37.7 
 
 		 243 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 302 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  47.92 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  38.75 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  19.55 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  51.61 
 
 		 158 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  44.93 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  30.14 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  41.67 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  31.07 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 255 aa  46.6  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  37.7 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  47.54 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1373  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 282 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 143 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  25.81 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  36.21 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>