223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2028 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 318 aa  644    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  38.56 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  34.8 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  35.16 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.22 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  34.3 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  29.3 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  26.59 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  25.77 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  30.66 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 300 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  27.92 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  27.41 
 
 		 322 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  26.86 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  26.51 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  25.94 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  29.15 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  27.52 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  25.41 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  23.53 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  25.09 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  29.37 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  27.35 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  31 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  26.34 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  30.64 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  20.87 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  29.59 
 
 		 201 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  24.71 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  24.42 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  32.39 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  34.07 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.07 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.07 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  30.81 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  33.12 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4927  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  29.59 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  18.86 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  18.86 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  18.86 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  18.86 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  19.48 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  18.86 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  32.9 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  32.43 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  27.41 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1612  putative transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  19.42 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.66 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.08 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  39.08 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  39.08 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  39.08 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  39.08 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  25.93 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  39.08 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  39.08 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  29.28 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  23.35 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  25.54 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  25.37 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  33.64 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  27.6 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  40.24 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  23.53 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>