More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2116 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 319 aa  656    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  91.22 
 
 		 319 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  57.37 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.4 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  36.58 
 
 		 293 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  29.15 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 292 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  27.04 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  29.44 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  28.26 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  25.94 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  28.19 
 
 		 322 aa  99  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 169 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  32.97 
 
 		 356 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  25.63 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  24.76 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  27.95 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  26 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  24.33 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  28.62 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  25.91 
 
 		 222 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  29.29 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  25.61 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5849  transcriptional regulator, MerR family  26.28 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  30.36 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  26.38 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  25.45 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1373  transcriptional regulator, MerR family  34.56 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  23.89 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  33.08 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  20.08 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  34.62 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5847  transcriptional regulator, MerR family  27.31 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  26.94 
 
 		 226 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  28.69 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  24.87 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  24.62 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  32.95 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  28.85 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  25.7 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  28.17 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  31.78 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  31.78 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  31.78 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  26.55 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  33.88 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  31.78 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>