208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6238 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 324 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  75 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  74.35 
 
 		 316 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  65.22 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  44.9 
 
 		 320 aa  265  7e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  45.87 
 
 		 301 aa  252  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  44.88 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  41.25 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 293 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  31.39 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  28.26 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  29.92 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  31.96 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.39 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  27.39 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  23.08 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  22.79 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  26.86 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  21.9 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  25.94 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  29.73 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  23.79 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  38.46 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  42.02 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  35.97 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  26.81 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  32.59 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  25.64 
 
 		 1154 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  28.27 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4228  putative sensor protein  50 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  19.13 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  30.3 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  26.67 
 
 		 1157 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  29.75 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  45.76 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  35.65 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.97 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  27.97 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  27.97 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  24.41 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  28.89 
 
 		 1158 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  27.97 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  28.99 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  24.22 
 
 		 1158 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  27.97 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.66 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  27.97 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  31.45 
 
 		 1189 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  33.03 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  31.11 
 
 		 1193 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  21.43 
 
 		 1168 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>