218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5173 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 291 aa  599  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  42.66 
 
 		 294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  36.93 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  44.95 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  29.3 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 333 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  24.48 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.03 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  25.11 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  22.26 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  21.92 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  25.52 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  20.08 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  26.13 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  22.79 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  22.88 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  23.26 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  21.98 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  25.55 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  27.43 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  35.96 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  35.96 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  29.17 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  29.17 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  23.89 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  40.3 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  26.29 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  34.74 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  34.74 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  34.74 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  34.74 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  23.87 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  21.63 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.04 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  28.04 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  28.04 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  28.04 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  28.04 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  28.04 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  28.04 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  30.95 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 121 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.58 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>