More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2306 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  100 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  100 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
243 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
243 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  99.18 
 
 
243 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  85.6 
 
 
243 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.773319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  85.19 
 
 
243 aa  431  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  85.19 
 
 
243 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  85.19 
 
 
243 aa  431  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  85.19 
 
 
243 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  85.19 
 
 
243 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  74.79 
 
 
243 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3252  hypothetical protein  82.33 
 
 
215 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472295 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1232  HTH-type transcriptional regulator MlrA  86.05 
 
 
179 aa  310  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
245 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  47.06 
 
 
243 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  47.06 
 
 
243 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 
243 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  47.06 
 
 
243 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  47.06 
 
 
243 aa  227  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  47.06 
 
 
243 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  47.06 
 
 
243 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
243 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  41.99 
 
 
242 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  41.56 
 
 
242 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
242 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  42.36 
 
 
242 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  42.36 
 
 
242 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
242 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  39.83 
 
 
241 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  34.85 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  31.03 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
265 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 
321 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  32.22 
 
 
314 aa  92.8  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
319 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
317 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1387  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 
282 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00489991  normal  0.361581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1372  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 
282 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0122562  hitchhiker  0.0000765424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
303 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1914  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 
282 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412659  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2095  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 
282 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000221737  hitchhiker  0.000000256129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1356  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 
282 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000135283  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
315 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
342 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
335 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
311 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
305 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
345 aa  85.9  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 
320 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
361 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
352 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
337 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  48.24 
 
 
310 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
366 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
298 aa  85.5  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  41.09 
 
 
342 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  32.68 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  45.35 
 
 
327 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  44.83 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
335 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  31.01 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
302 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  40.79 
 
 
319 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  29.32 
 
 
315 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
97 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
97 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
322 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 
163 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 
157 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 
389 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  44.29 
 
 
157 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 
291 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 
134 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
130 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 
133 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  41.43 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 
157 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  38.81 
 
 
123 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>