162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1049 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  49.51 
 
 		 301 aa  281  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 319 aa  257  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  50.34 
 
 		 320 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  46.2 
 
 		 316 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  44.88 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  43.77 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  39.46 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  28.52 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  31.51 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  28.84 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  29.2 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  31.31 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  27.65 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.54 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  25.5 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  26.22 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  28.14 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  22.42 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  20.27 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  43.28 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  29.09 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  37.66 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0686  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 363 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.162378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  27.11 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4228  putative sensor protein  46.15 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  39.68 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  28.24 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4927  MerR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  25.64 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  28.68 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2587  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.46 
 
 		 370 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  36 
 
 		 132 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  23.21 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  28.05 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  25.58 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 169 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 		 144 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3056  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  30.93 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  29 
 
 		 132 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3983  cobalamin B12-binding  26.9 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 137 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>