More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2702 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 
305 aa  631  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  46.08 
 
 
315 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  42.72 
 
 
319 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  40.4 
 
 
319 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
333 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  33.44 
 
 
335 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 
318 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
293 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  39.04 
 
 
293 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
302 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  29.14 
 
 
291 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  29.62 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
291 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  30.94 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  30.94 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  29.82 
 
 
322 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
315 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
290 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
302 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
169 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
298 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  26.39 
 
 
324 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  25.76 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  25.76 
 
 
290 aa  89  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  26.33 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  24.07 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  25.54 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  38.1 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  28.91 
 
 
372 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  26.03 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  28.06 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  27.17 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  26.62 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  29.56 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  30.8 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
319 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  33.55 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  25.58 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
321 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.39 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.59 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.26 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  33.1 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  31.08 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  33.33 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  26.38 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  24.88 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  27.2 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  26.64 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  23.26 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  27.67 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  25.41 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  28.91 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  27.27 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.74 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
311 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.6 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  28.06 
 
 
781 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  28.49 
 
 
363 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  26.32 
 
 
780 aa  63.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  31.16 
 
 
339 aa  63.2  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  28.33 
 
 
816 aa  62.8  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
265 aa  62.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  30.77 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  24.15 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  25.17 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  32.09 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  31.85 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  23.55 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1373  transcriptional regulator, MerR family  31.54 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  22.61 
 
 
1189 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5849  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.66 
 
 
336 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.66 
 
 
336 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
242 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
245 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>