More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0917 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  99.59 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  99.59 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  99.59 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  99.18 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  99.18 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3252  hypothetical protein  98.6 
 
 		 215 aa  430  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  86.01 
 
 		 243 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  86.01 
 
 		 243 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  85.6 
 
 		 243 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  85.6 
 
 		 243 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  85.6 
 
 		 243 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  79.34 
 
 		 243 aa  400  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1232  HTH-type transcriptional regulator MlrA  99.42 
 
 		 179 aa  348  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.54 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  48.54 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  48.54 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  48.54 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  48.54 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  48.54 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  48.54 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  43.67 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  43.67 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  40.26 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  30.3 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  34.34 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1387  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 282 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00489991  normal  0.361581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1914  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1372  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 282 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0122562  hitchhiker  0.0000765424 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2095  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 282 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000221737  hitchhiker  0.000000256129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1356  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 282 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000135283  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  31.35 
 
 		 314 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 299 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  58.57 
 
 		 321 aa  92  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 317 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 319 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 303 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 342 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 299 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 335 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 337 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 311 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  41.09 
 
 		 342 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 361 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 311 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 352 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 345 aa  85.1  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  38.6 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  30.23 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  31.78 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  42.86 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 322 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  35.23 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 97 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  34 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  44.29 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  44.29 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  43.06 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  38.27 
 
 		 92 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  40.28 
 
 		 159 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>