154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1384 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  40.13 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  41.25 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  40.2 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  40.22 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  37.66 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 319 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.78 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  25.08 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  30.9 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  26.07 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  28.44 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  24.08 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  26.39 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  27.35 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  29.21 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  26.61 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  24.89 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  26.04 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2587  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  43.04 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3056  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  26.51 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4228  putative sensor protein  41.27 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0686  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 363 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.162378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  36.43 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.79 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  25.79 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  29.61 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  26.98 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  26.98 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  26.98 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  25.79 
 
 		 243 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  26.98 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  25.33 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  24.86 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  34.52 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0738  putative transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.878352  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  28.36 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  26.61 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  37.66 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  39.66 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 282 aa  49.7  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4927  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1812  transcriptional regulator, MerR family  40.82 
 
 		 386 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  29.46 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>