288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0376 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
293 aa  584  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  80.55 
 
 
293 aa  474  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  36.88 
 
 
319 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  36.21 
 
 
319 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  35.12 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  39.91 
 
 
305 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 
318 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
335 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
333 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  34.63 
 
 
324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  34.8 
 
 
298 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  33.48 
 
 
304 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
300 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
315 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
321 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  32.17 
 
 
290 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
319 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
302 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  31.89 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  28.88 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
316 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  30.74 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
311 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  32.05 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  30.13 
 
 
337 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  24.29 
 
 
315 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  30.1 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.076426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.56 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  27.54 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  32.56 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  32.56 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  32.56 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  32.56 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  32.56 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  25.62 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  37.09 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  33.59 
 
 
267 aa  79  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  26.36 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
295 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  30.2 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  25.65 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  25.65 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  25.54 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
243 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  28.24 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  30.23 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  30.23 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  29.3 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1373  transcriptional regulator, MerR family  35.2 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  24.89 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  32.75 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.75 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.75 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  29.08 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  29.9 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  30.3 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  25.86 
 
 
372 aa  68.9  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  30.3 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  30.3 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  30.3 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  28.77 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  26.19 
 
 
768 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.29 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 
247 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  34.34 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
352 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>