More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1180 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  84.3 
 
 
242 aa  427  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  77.27 
 
 
241 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  71.49 
 
 
242 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  71.49 
 
 
242 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  71.49 
 
 
242 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  71.9 
 
 
242 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  47.5 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
243 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
243 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  42.86 
 
 
243 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 
243 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  42.86 
 
 
243 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  42.86 
 
 
243 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
243 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  41.56 
 
 
243 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
243 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  41.56 
 
 
243 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
243 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.66 
 
 
243 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  37.66 
 
 
243 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  37.23 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  37.23 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  37.23 
 
 
243 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  37.23 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  37.23 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
245 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3252  hypothetical protein  38.83 
 
 
215 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2095  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 
282 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000221737  hitchhiker  0.000000256129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1232  HTH-type transcriptional regulator MlrA  40.59 
 
 
179 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1387  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00489991  normal  0.361581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1914  putative transcriptional regulator  37 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1372  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0122562  hitchhiker  0.0000765424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1356  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000135283  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
321 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
317 aa  95.1  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
305 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
299 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  31.86 
 
 
267 aa  89  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  48.94 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  26.25 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
311 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
303 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 
302 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  33.61 
 
 
314 aa  86.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
320 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  49.38 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  49.38 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 
299 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
352 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  55.38 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
112 aa  62.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  27.81 
 
 
315 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
293 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
300 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
333 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
169 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  54.35 
 
 
322 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
292 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
292 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 
157 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 
157 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  36.08 
 
 
163 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>