280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4353 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 321 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 321 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 323 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  44.11 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  41.77 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  37.66 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  34.88 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  39.06 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 117 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  40.35 
 
 		 111 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  35.82 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 116 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.82 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  35.82 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  36.36 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1892  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  36.36 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  35.82 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  35.82 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  35.82 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  36.36 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  36.36 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1445  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.236755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  37.88 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 169 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 110 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 127 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  42.86 
 
 		 117 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0580  hypothetical protein  35.82 
 
 		 109 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 361 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  29.76 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2509  transcriptional regulator, MerR family  41.11 
 
 		 160 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2140  transcriptional regulator, MerR family  41.11 
 
 		 160 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  34.85 
 
 		 267 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  45.1 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  41.82 
 
 		 109 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  54.9 
 
 		 159 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  52 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 144 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  37.88 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  30.86 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  37.88 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>