245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1060 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  37.46 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  38.24 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  38.72 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  29.41 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  25.11 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  28.39 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  27.89 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  26.5 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  27.53 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  27.38 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  26.58 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  28.25 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  25.21 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  29.11 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  23.38 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  26.56 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  25.1 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  26.07 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  22.79 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  21.33 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  28.57 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  23.67 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  29.37 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  22.69 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  23.98 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  22.69 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  39.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  39.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  31.31 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  26.82 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  29.82 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  38.57 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  41.27 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 116 aa  53.9  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 		 112 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  21.8 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 134 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  30.99 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  21.26 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  25.35 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  25.52 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  30.99 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 121 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  29.17 
 
 		 366 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  29.17 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 134 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  30.97 
 
 		 134 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  29.17 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  29.17 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 134 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 134 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 134 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>