180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2399 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 316 aa  632  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  98.1 
 
 		 316 aa  620  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  75 
 
 		 324 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  68.52 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  44.55 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 319 aa  255  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  45.57 
 
 		 301 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  46.2 
 
 		 304 aa  245  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  30.82 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  30.4 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  29.45 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  31.38 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.62 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  27.63 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  24.6 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  30.49 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  23.46 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  22.88 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  22.11 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  20.22 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  26.45 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  48.48 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  36.97 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  29.92 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 303 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  40.82 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4228  putative sensor protein  47.46 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.83 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2587  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  30.83 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  30.83 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  30.83 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  30.83 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  27.46 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  30.83 
 
 		 243 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 291 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  31.31 
 
 		 1157 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  29 
 
 		 1158 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  28.12 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 169 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  28.32 
 
 		 1154 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  37.7 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  37.7 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  37.7 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  37.7 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>