117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2584 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 354 aa  684    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  45.73 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  46.95 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  44.24 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.24 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.24 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  45.51 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.65 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  39.35 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  35.33 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  35.67 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.67 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.67 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  27.47 
 
 		 222 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  27.14 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  30.57 
 
 		 349 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  34.76 
 
 		 339 aa  86.3  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  32.3 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  31.84 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.19 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  30.64 
 
 		 780 aa  70.5  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  27.18 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  29.63 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  28.5 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  29.35 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  30.16 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  23.02 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  28 
 
 		 793 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  28.35 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  28.24 
 
 		 781 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  26.8 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  29.09 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  25.64 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  30.33 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  27.52 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0655  cobalamin B12-binding domain protein  23.04 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.32 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  36.36 
 
 		 816 aa  56.6  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  31.12 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  25.25 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  17.73 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  26.47 
 
 		 224 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  36.79 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  24.75 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  25.93 
 
 		 209 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  29.71 
 
 		 293 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  27.14 
 
 		 207 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  27.14 
 
 		 207 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1431  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.37 
 
 		 222 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  24.75 
 
 		 1132 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  25.25 
 
 		 1132 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  26.83 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  29.76 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.37 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  24.88 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.44 
 
 		 1132 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.44 
 
 		 1132 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.44 
 
 		 1133 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.44 
 
 		 1133 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.44 
 
 		 1132 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.86 
 
 		 219 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  22.47 
 
 		 841 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.44 
 
 		 1132 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.44 
 
 		 1132 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  24.75 
 
 		 1132 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  26 
 
 		 801 aa  49.7  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  22.87 
 
 		 804 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.84 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  28.8 
 
 		 212 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  28.09 
 
 		 1250 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  25.64 
 
 		 768 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  27.03 
 
 		 832 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  24.29 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  30.48 
 
 		 226 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  25.6 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  24.06 
 
 		 804 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  22.84 
 
 		 216 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2399  methionine synthase (B12-dependent)  31.31 
 
 		 902 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  24.79 
 
 		 768 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  23.85 
 
 		 811 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  27.52 
 
 		 294 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  33.33 
 
 		 1168 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  27.55 
 
 		 802 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  27.48 
 
 		 214 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  29.41 
 
 		 1243 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3738  cobalamin B12-binding  24.37 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0514741  hitchhiker  0.000397426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  24.39 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  29.27 
 
 		 1215 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  25.12 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  24.58 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  25 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>