287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3741 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 112 aa  226  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  49.53 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  47.17 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  48.6 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  46.73 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  47.92 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  47.32 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  47.22 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  58.97 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  45.95 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  56.63 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  45.37 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  45.87 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  45.37 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 118 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  42.59 
 
 		 118 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  41.67 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 162 aa  97.1  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 141 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  48.04 
 
 		 118 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  48.04 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  55.56 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  56.58 
 
 		 173 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  56.41 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  56.41 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  56.58 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  55 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  56.41 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  56.58 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  53.75 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  53.75 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2223  transcriptional regulator, MerR family  52.7 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000299442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1997  transcriptional regulator, MerR family  52.7 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  46.25 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2991  transcriptional regulator, MerR family  42.2 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.950452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1705  transcriptional regulator, MerR family  38.2 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  51.43 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1259  transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  40.26 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1669  MerR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0840  transcriptional regulator, MerR family  27.91 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1864  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0288491  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0051  transcriptional regulator, MerR family  39.36 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  42.55 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1596  transcriptional regulator, MerR family  29.69 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.265626  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0779  hypothetical protein  43.48 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>