194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1107 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  612  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  39.43 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  31.46 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  30.88 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  25.37 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  31.77 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  29.09 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  27.07 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  28.72 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  27.39 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  31.72 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  29.05 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  29.22 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  30.24 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  26.73 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  31.71 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  28.69 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  27.18 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  46.23 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  28 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  25.88 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  23.27 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  49.32 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  23.27 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  30.77 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  31.41 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  33.54 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  27.42 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  24.18 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  24.04 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 128 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.85 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  25 
 
 		 768 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  28.18 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 169 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  27.39 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.3 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  27.11 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  33.78 
 
 		 241 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2587  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1259  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 121 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  28.34 
 
 		 802 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  39.06 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  23.53 
 
 		 768 aa  49.7  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  32.1 
 
 		 110 aa  49.7  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 169 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  26.47 
 
 		 1150 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0640  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 168 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  26.47 
 
 		 1150 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3056  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  33.87 
 
 		 818 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  29.92 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  31.75 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  26.5 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7073  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 172 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6232  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 177 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0686  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.162378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>