More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1868 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  47.5 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  46.25 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  46.67 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  46.67 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 243 aa  198  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.75 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  38.75 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  38.33 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  38.33 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  38.33 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  38.33 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  39.58 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  39.58 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  39.58 
 
 		 243 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  39.58 
 
 		 243 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  38.66 
 
 		 243 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  38.66 
 
 		 243 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3252  hypothetical protein  36.32 
 
 		 215 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1372  putative transcriptional regulator  36.13 
 
 		 282 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0122562  hitchhiker  0.0000765424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1387  putative transcriptional regulator  36.13 
 
 		 282 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00489991  normal  0.361581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1914  putative transcriptional regulator  36.13 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412659  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2095  putative transcriptional regulator  36.13 
 
 		 282 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000221737  hitchhiker  0.000000256129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1356  putative transcriptional regulator  36.13 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000135283  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1232  HTH-type transcriptional regulator MlrA  39.01 
 
 		 179 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  32.45 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  31.22 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  29.57 
 
 		 314 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 320 aa  92  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 361 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 352 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 293 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 299 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 299 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 299 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 299 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 345 aa  85.5  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  56.92 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  52.05 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  49.38 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  49.38 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 302 aa  72  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  32.12 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  39.73 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.3 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.3 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  37.8 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  28.02 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 		 132 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>