152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1448 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  53.25 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  53.57 
 
 		 316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  53.4 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  53.4 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 301 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  47.67 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  39.85 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  27.52 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  27 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  31.6 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  26 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  30.21 
 
 		 293 aa  93.2  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  29.54 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  26.42 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  26.25 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  24.83 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  22.64 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  21.71 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  29.77 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  32.42 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  28.51 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0686  transcriptional regulator, MerR family  41.49 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.162378  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  49.18 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  28.08 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  33.83 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 245 aa  53.1  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.61 
 
 		 370 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 169 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  43.02 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.87 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  40.58 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.85 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  34.85 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  34.85 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  34.85 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  34.85 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  33.33 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4228  putative sensor protein  45.1 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  26.87 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 137 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 265 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  20.67 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  25.5 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5847  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 243 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>