205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3717 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  100 
 
 		 315 aa  641    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  36.93 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  34.1 
 
 		 298 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  39.46 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  26.25 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  25.63 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  26.55 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  26.53 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  28.38 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  25.1 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  25.5 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  23.13 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  21.48 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  21.18 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.64 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  23.44 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  22.11 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  25 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  23.79 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  24.63 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  21.27 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  21.74 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  25.09 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  21.74 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  37.8 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  37.8 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  30.97 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  22.73 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  38.24 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  22.73 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  31.58 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  31.52 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  22.75 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  36 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  21.31 
 
 		 364 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 242 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  24.47 
 
 		 224 aa  53.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3056  transcriptional regulator, MerR family  29.7 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 326 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.85 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  34.85 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3031  MerR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 142 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.532106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  34.85 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  29.41 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  34.85 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  34.85 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  34.85 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  29.79 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>