158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1411 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
291 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  74.57 
 
 
292 aa  454  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  74.23 
 
 
291 aa  454  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  74.23 
 
 
292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  74.23 
 
 
291 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  73.88 
 
 
291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  74.23 
 
 
291 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  73.2 
 
 
291 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  71.13 
 
 
291 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  53.49 
 
 
302 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  83.85 
 
 
169 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1615  MerR family transcriptional regulator  61.9 
 
 
126 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000266669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.37 
 
 
305 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  27.38 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  27.38 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  25.76 
 
 
319 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
333 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  22.04 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  28.63 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  28.25 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  30.72 
 
 
343 aa  77  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  28.5 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  25.82 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  26.51 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  27.06 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  28.4 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  21.55 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  27.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  27.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  27.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  27.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  27.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  27.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  21.33 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
295 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  34.52 
 
 
247 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
345 aa  62.4  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  40.26 
 
 
241 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  25.73 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
317 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  25.59 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  22.83 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
352 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  21.25 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  26.52 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  26.52 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
299 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
299 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
361 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  20.42 
 
 
298 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
326 aa  55.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 
322 aa  55.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  22.41 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  19.83 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  23.05 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5847  transcriptional regulator, MerR family  23.04 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 
389 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  26.61 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  34.33 
 
 
243 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 
242 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  24.67 
 
 
243 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
117 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  34.33 
 
 
243 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
243 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  34.33 
 
 
243 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  31.68 
 
 
342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>