More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2740 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  97.97 
 
 		 295 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  71.24 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 311 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 310 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  33.67 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  33.46 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  28.24 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  62.71 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  62.71 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  62.71 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  45.98 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  62.71 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  62.71 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  62.71 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  62.71 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 335 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  35.04 
 
 		 267 aa  89  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  38.85 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 337 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  33.11 
 
 		 343 aa  86.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 326 aa  85.9  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 352 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  57.81 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  57.81 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  48.78 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  57.81 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  48.78 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  57.81 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  57.81 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  29.44 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  28.79 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  29.26 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  29.6 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  54.24 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  54.24 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  30.13 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  27.74 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  27.74 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  27.22 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.15 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  27.22 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5849  transcriptional regulator, MerR family  41.49 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  26.32 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  21.77 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>