More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2126 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  39.34 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  39.84 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  50.63 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  57.14 
 
 		 343 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  37.25 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  51.47 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 342 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  46.34 
 
 		 300 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  52.94 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  36.84 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  36.84 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  33.9 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.9 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  33.9 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  33.9 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  33.9 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  33.9 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  36.84 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 326 aa  82  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  36.84 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  36.84 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  49.25 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  49.25 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  30.3 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  35.43 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 169 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  34.62 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  42.11 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  42.86 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 138 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  38.16 
 
 		 92 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  39.71 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  32.61 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>