More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5308 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  93.31 
 
 
299 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  57.81 
 
 
300 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  59.04 
 
 
313 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  58.48 
 
 
302 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  55.59 
 
 
320 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  52.92 
 
 
314 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  49.82 
 
 
299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  49.82 
 
 
299 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  50.35 
 
 
299 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
293 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
305 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
321 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
319 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
311 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
302 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
303 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
310 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  36.52 
 
 
319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
311 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
298 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
342 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
335 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  43.21 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
326 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  40.72 
 
 
352 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
317 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  42.33 
 
 
337 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
345 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
361 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
366 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
265 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
315 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  40.62 
 
 
267 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
295 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
295 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  37.98 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  32.2 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
302 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  39.52 
 
 
243 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  39.52 
 
 
243 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  39.52 
 
 
243 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  39.52 
 
 
243 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
243 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  39.52 
 
 
243 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
243 aa  92.4  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.98 
 
 
243 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  39.84 
 
 
241 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  32.98 
 
 
243 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  38.21 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  38.21 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  38.21 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  38.21 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  42.86 
 
 
242 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
242 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
242 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  42.86 
 
 
242 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  35.62 
 
 
319 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
335 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  37.4 
 
 
243 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  37.9 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  37.9 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  42.4 
 
 
327 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  29.38 
 
 
343 aa  85.9  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.8 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  30.81 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  30.85 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  33.75 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  29.24 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  29.24 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
245 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  37.82 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  27.67 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  34.59 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  31.1 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3252  hypothetical protein  33 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472295 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1232  HTH-type transcriptional regulator MlrA  33 
 
 
179 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>