224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4396 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 342 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  44.11 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  44.11 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 349 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  49.38 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5856  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 117 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  44.78 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  46.27 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  42.42 
 
 		 241 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0284  hypothetical protein  31.33 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.02693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  42.42 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  42.42 
 
 		 242 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 242 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  45.76 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  42.65 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 242 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  36.36 
 
 		 243 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 110 aa  53.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  36.36 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  36.36 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  36.36 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  31.82 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  40.32 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 265 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 116 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  36.36 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  36.36 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  38.71 
 
 		 117 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 116 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  42.42 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 127 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  27.5 
 
 		 159 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  36.36 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  36.36 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  29.63 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 292 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 291 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>