More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2355 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  670    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  42.14 
 
 		 342 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  51.28 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  37.63 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  37.63 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  40 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 243 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  40 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  38.64 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  40.91 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  40.91 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  34.41 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  40.91 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.39 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  39.39 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  39.39 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  39.39 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  39.39 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  29.05 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  39.76 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  50.85 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  50.85 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  43.75 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  37.11 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  45.31 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  49.02 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  27.45 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  39.51 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  35.87 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  35.05 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  32.89 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  34.57 
 
 		 159 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1705  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 133 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 137 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  47.92 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  34.85 
 
 		 267 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>