241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1705 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1705  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1328  MerR family transcriptional regulator  74.44 
 
 		 142 aa  207  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1058  transcriptional regulator, MerR family  72.18 
 
 		 133 aa  206  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1889  MerR family transcriptional regulator  71.64 
 
 		 134 aa  200  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171431  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1596  transcriptional regulator, MerR family  66.17 
 
 		 133 aa  191  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.265626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  67.67 
 
 		 133 aa  190  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0840  transcriptional regulator, MerR family  63.91 
 
 		 133 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  35.94 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  35.94 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  43.21 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  43.21 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  48.53 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  38.2 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  36.89 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  34.65 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  43.04 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1445  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.236755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  37.5 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  45.59 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1259  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  40 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  44.12 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0580  hypothetical protein  37.33 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  48.28 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1892  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1669  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1997  transcriptional regulator, MerR family  46.55 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0108  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2223  transcriptional regulator, MerR family  46.55 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000299442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  41.18 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  34.44 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  34.44 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  39.13 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1052  transcriptional regulator, putative  36.17 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.019007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2382  transcriptional regulator, MerR family  33.68 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>