More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2462 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
258 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
250 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
238 aa  95.9  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  23.97 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  27.39 
 
 
254 aa  85.1  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  24.49 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  28.06 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  27.31 
 
 
249 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  24.6 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  24.08 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  27.84 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  25 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  24.6 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  26.8 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  23.67 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  23.67 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  26.62 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  23.67 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  23.67 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  23.67 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  22.76 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  25.51 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  24.8 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  25.29 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  25.88 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  28.07 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  21.25 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  19.83 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  24.9 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  22.95 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  23.55 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  24.8 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  23.01 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  29.09 
 
 
342 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  26.58 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  28.71 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  21.25 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  43.24 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  42.39 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
166 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  39.6 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  24 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
166 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
166 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  38.27 
 
 
250 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  28.29 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  41.3 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
166 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  24.03 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 
342 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
343 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
136 aa  62  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
256 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 
256 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2331  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 
141 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00979491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
343 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
288 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  45.59 
 
 
347 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
141 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  23.77 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
133 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>