159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1817 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1817  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 287 aa  561  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4927  MerR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 314 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4437  regulatory protein, MerR  43.96 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6541  transcriptional regulator, MerR family  37.95 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1612  putative transcriptional regulator, MerR family  33.43 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  30.95 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  31.23 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2587  transcriptional regulator, MerR family  63.64 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  30.08 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0686  transcriptional regulator, MerR family  64.06 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.162378  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3056  transcriptional regulator, MerR family  65.08 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0738  putative transcriptional regulator, MerR family  62.96 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.878352  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0370  regulatory protein MerR  34.48 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0637  transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28680  predicted transcriptional regulator  32.54 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  29.61 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  24.22 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  29.39 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.99 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  22.75 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  27.69 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  36.05 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  35.71 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  36.05 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  35.71 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  36.05 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  36.05 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  28.02 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  28.9 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  46.55 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  21.46 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  26.26 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.39 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  39.39 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  39.39 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  39.39 
 
 		 243 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  39.39 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  39.39 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  43.1 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  39.44 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  21.72 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  39.44 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  19.31 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  28.71 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  21.4 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 242 aa  49.3  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  38.75 
 
 		 124 aa  48.9  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  30.1 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  29.82 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>