248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1691 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 339 aa  685    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.42 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  36.69 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 356 aa  149  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  34.05 
 
 		 201 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  25.55 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  32.77 
 
 		 222 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  27.74 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  28.14 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  32.46 
 
 		 356 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  34.76 
 
 		 354 aa  86.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  31.36 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  32.21 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  31.44 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  27.84 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  29.29 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  27.66 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  29.78 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1728  cobalamin B12-binding domain protein  26.61 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  29.34 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.57 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  26.55 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  30.46 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  32.43 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  26.13 
 
 		 251 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  27.49 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  31.71 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  31.71 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  26.76 
 
 		 800 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  30.13 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  25.95 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  25.95 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0655  cobalamin B12-binding domain protein  21.67 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  32.38 
 
 		 214 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  25.51 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3983  cobalamin B12-binding  25.39 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  24.34 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  25.63 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  22.8 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  27.7 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  25.64 
 
 		 804 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  22.7 
 
 		 841 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  26.9 
 
 		 804 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  26.49 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0956  cobalamin B12-binding protein  22.05 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  24.28 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  26.28 
 
 		 768 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  26.92 
 
 		 768 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  28 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  29.14 
 
 		 1168 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.32 
 
 		 219 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  28.42 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.42 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.42 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  23.35 
 
 		 214 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  28.27 
 
 		 818 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3738  cobalamin B12-binding  23.5 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0514741  hitchhiker  0.000397426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  24.15 
 
 		 804 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  27.84 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.78 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.77 
 
 		 211 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  25.91 
 
 		 807 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  28.24 
 
 		 219 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  25 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  25.97 
 
 		 793 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  28.95 
 
 		 816 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  22.93 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  24.75 
 
 		 806 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.16 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  32 
 
 		 804 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  28.43 
 
 		 228 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0262  AppA/PpaA family photosynthesis gene regulator  26.82 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  22.93 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 208 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  24.32 
 
 		 232 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  24.34 
 
 		 801 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  33.58 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  26.02 
 
 		 841 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  24.86 
 
 		 607 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  26.62 
 
 		 781 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 217 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  28.21 
 
 		 820 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  23.33 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  27.64 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2044  cobalamin B12-binding domain protein  25.7 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.10014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  29.66 
 
 		 1269 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  25.81 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>