More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0141 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
816 aa  1607    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  42.88 
 
 
804 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  41.96 
 
 
804 aa  531  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  40.35 
 
 
800 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  39.26 
 
 
839 aa  531  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  40.1 
 
 
804 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  36.76 
 
 
807 aa  521  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  40.9 
 
 
801 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  40.7 
 
 
806 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  40.45 
 
 
820 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  35.92 
 
 
804 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  39.16 
 
 
811 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  36.51 
 
 
819 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  34.94 
 
 
791 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  39.48 
 
 
813 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  38.71 
 
 
801 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  38.84 
 
 
818 aa  459  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  38.88 
 
 
804 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  39.18 
 
 
804 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  39.21 
 
 
802 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  39.42 
 
 
803 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  32.65 
 
 
841 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  38.38 
 
 
841 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  34.32 
 
 
768 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  34.37 
 
 
768 aa  436  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.08 
 
 
774 aa  430  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  32.88 
 
 
780 aa  413  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  31.28 
 
 
781 aa  411  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  30.94 
 
 
793 aa  389  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  30.8 
 
 
1132 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.77 
 
 
1132 aa  348  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  31.03 
 
 
1132 aa  347  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  31 
 
 
1132 aa  347  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.46 
 
 
1132 aa  346  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  33.9 
 
 
1189 aa  346  8.999999999999999e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.33 
 
 
1132 aa  346  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.79 
 
 
1132 aa  346  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.79 
 
 
1132 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.79 
 
 
1133 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.79 
 
 
1132 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  34.4 
 
 
1150 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  33.72 
 
 
1158 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.79 
 
 
1133 aa  343  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  32.72 
 
 
1136 aa  343  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  33.69 
 
 
1150 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  33.57 
 
 
1150 aa  340  8e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  34.52 
 
 
1149 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  32.41 
 
 
1191 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  32.29 
 
 
1191 aa  334  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  31.56 
 
 
1183 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  31.72 
 
 
1136 aa  333  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  30.89 
 
 
1226 aa  324  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  32.22 
 
 
1220 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  30.81 
 
 
1274 aa  321  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  31.36 
 
 
1235 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  30.53 
 
 
1224 aa  320  9e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  31.08 
 
 
1235 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  31.27 
 
 
1236 aa  319  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  31.08 
 
 
1235 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  31.02 
 
 
1169 aa  319  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  30.31 
 
 
1261 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  27.71 
 
 
1182 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  27.71 
 
 
1182 aa  318  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  30.4 
 
 
1180 aa  318  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  27.85 
 
 
1188 aa  318  4e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  31.54 
 
 
1225 aa  317  7e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  31.4 
 
 
1158 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  29.99 
 
 
1226 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  30.98 
 
 
1154 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  31.06 
 
 
1235 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  31.41 
 
 
1154 aa  316  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  31.44 
 
 
1278 aa  315  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  31.75 
 
 
1236 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  26.95 
 
 
1187 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  29.55 
 
 
1227 aa  314  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  27.92 
 
 
1188 aa  313  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  31.4 
 
 
1215 aa  312  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.8 
 
 
1163 aa  312  2e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  30.42 
 
 
1227 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  31.76 
 
 
1249 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  30.53 
 
 
1267 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  31.17 
 
 
1178 aa  310  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  31.22 
 
 
1234 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  30.26 
 
 
1227 aa  310  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  29.52 
 
 
1230 aa  310  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  30.54 
 
 
1227 aa  310  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.64 
 
 
1239 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  30.54 
 
 
1227 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  30.54 
 
 
1227 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  30.96 
 
 
1224 aa  308  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  30.08 
 
 
1230 aa  308  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  30.38 
 
 
1245 aa  308  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  30.54 
 
 
1227 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  30.82 
 
 
1192 aa  308  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  30.05 
 
 
1230 aa  307  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  30.05 
 
 
1231 aa  307  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  31.13 
 
 
1234 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  30.01 
 
 
1271 aa  307  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  30.42 
 
 
1227 aa  307  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  29.58 
 
 
1229 aa  307  6e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>