More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0729 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  100 
 
 
212 aa  415  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  64.11 
 
 
209 aa  265  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  62.62 
 
 
213 aa  261  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  57.89 
 
 
210 aa  237  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  57.97 
 
 
210 aa  236  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  62.57 
 
 
210 aa  232  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  53.33 
 
 
210 aa  230  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  53.37 
 
 
210 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.58 
 
 
326 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  53.69 
 
 
212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  53.85 
 
 
210 aa  218  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  52.02 
 
 
232 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  52.02 
 
 
232 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  50.73 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  49.28 
 
 
607 aa  212  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  52.38 
 
 
213 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  51.01 
 
 
232 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  46.67 
 
 
210 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  54.21 
 
 
259 aa  205  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  47.57 
 
 
232 aa  204  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  51.79 
 
 
235 aa  203  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  51.04 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.71 
 
 
208 aa  197  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  50 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.09 
 
 
219 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  45.63 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  45.37 
 
 
219 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  52.33 
 
 
224 aa  192  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  44.02 
 
 
218 aa  192  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  45.24 
 
 
214 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  51.98 
 
 
210 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  45.81 
 
 
221 aa  185  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  48.56 
 
 
208 aa  184  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  48.31 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  47.39 
 
 
210 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  43.75 
 
 
220 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  44.98 
 
 
251 aa  175  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  43.41 
 
 
804 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  46.33 
 
 
556 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  42.58 
 
 
217 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  43.9 
 
 
804 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  46.84 
 
 
219 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  40.29 
 
 
224 aa  168  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  42.65 
 
 
214 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  40.98 
 
 
841 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  44.66 
 
 
801 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  40.98 
 
 
800 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  38.39 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  39.81 
 
 
804 aa  162  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  45.41 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  43.81 
 
 
1136 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  46.99 
 
 
211 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  42.03 
 
 
804 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  43.37 
 
 
207 aa  158  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  42.05 
 
 
216 aa  158  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  41.95 
 
 
804 aa  157  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  42.86 
 
 
207 aa  157  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  47.31 
 
 
168 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  42.86 
 
 
811 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  39.11 
 
 
216 aa  155  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  43.41 
 
 
220 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  39.81 
 
 
1132 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  42.65 
 
 
813 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  41.06 
 
 
804 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  45.56 
 
 
216 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.95 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  40.58 
 
 
818 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  41.63 
 
 
841 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  38.46 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.52 
 
 
1132 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  40.59 
 
 
801 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  40.98 
 
 
806 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  39.34 
 
 
1132 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  38.1 
 
 
218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  40.78 
 
 
802 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.46 
 
 
211 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.39 
 
 
1132 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.57 
 
 
1132 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.57 
 
 
1132 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.39 
 
 
1132 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.39 
 
 
1132 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.57 
 
 
1133 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.57 
 
 
1133 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  38.57 
 
 
1132 aa  148  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  39.81 
 
 
1136 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  37.02 
 
 
216 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  36.49 
 
 
213 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  41.57 
 
 
215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  39.05 
 
 
819 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  37.44 
 
 
217 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  36.71 
 
 
803 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  37.02 
 
 
839 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  37.44 
 
 
217 aa  142  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  39.34 
 
 
1169 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  41.94 
 
 
791 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  37.69 
 
 
807 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  36.5 
 
 
206 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  35.98 
 
 
1181 aa  137  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  38.5 
 
 
1183 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  39.77 
 
 
820 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>