More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1110 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  49.76 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.85 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  44.71 
 
 		 212 aa  197  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  48.33 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  52.94 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  50 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  46.15 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  45.77 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  46.15 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  46.41 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  46.91 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  45.93 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  48.98 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  49.24 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  46.41 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  49.24 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  45.24 
 
 		 326 aa  175  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  50.8 
 
 		 232 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  44.5 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  43.75 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  50 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  50 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  46.57 
 
 		 259 aa  171  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  52.69 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  38.73 
 
 		 607 aa  168  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  42.08 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  45.15 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  45.98 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.39 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.39 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  40.49 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  44.93 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  38.68 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  41.55 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  49.1 
 
 		 168 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  39.71 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  40.59 
 
 		 800 aa  154  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  42.65 
 
 		 804 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  39.51 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  42.05 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  42.94 
 
 		 556 aa  151  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  40.29 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  43.23 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  41.95 
 
 		 841 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  41.26 
 
 		 818 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  41.46 
 
 		 804 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  41.71 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  47.5 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  39.91 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  42 
 
 		 803 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  39.81 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.21 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  40 
 
 		 802 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  35.92 
 
 		 841 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  37.82 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  42.26 
 
 		 801 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  40.69 
 
 		 804 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  39.71 
 
 		 813 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  40.2 
 
 		 811 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  41.01 
 
 		 213 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.62 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  35.78 
 
 		 839 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  42.42 
 
 		 820 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  38.98 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  38.32 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  38.92 
 
 		 791 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  38.24 
 
 		 801 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  34.98 
 
 		 804 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  37.75 
 
 		 804 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  40.51 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  40.51 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  35.39 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  32.64 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  41.18 
 
 		 816 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  38.39 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  38.31 
 
 		 807 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  35.1 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  38.39 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  36.52 
 
 		 211 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  34.83 
 
 		 768 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  37.2 
 
 		 804 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  36.76 
 
 		 806 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  35.1 
 
 		 617 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  34.16 
 
 		 768 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  40 
 
 		 1157 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  36.95 
 
 		 1181 aa  122  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  38.17 
 
 		 1156 aa  122  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  38.95 
 
 		 1216 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  31.88 
 
 		 819 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.18 
 
 		 774 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  36.1 
 
 		 1168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  38.07 
 
 		 1193 aa  118  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  33.68 
 
 		 1178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  37.14 
 
 		 1176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  37.5 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  38.46 
 
 		 217 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.95 
 
 		 1163 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>