More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4325 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  100 
 
 		 214 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  45.24 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  42.86 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  42.92 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  47.62 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  45.05 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  42.72 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  44.34 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  40.28 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  43.63 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.31 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.85 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  39.62 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  42.18 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  46.19 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  41.78 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  46.04 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  41.04 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  42.72 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  44.34 
 
 		 251 aa  165  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  42.42 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.68 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  42.06 
 
 		 839 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  41.28 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  39.52 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  48.48 
 
 		 168 aa  158  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.56 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  41.45 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  42.31 
 
 		 800 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  41.35 
 
 		 804 aa  154  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.94 
 
 		 326 aa  153  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  40.67 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  40.09 
 
 		 804 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  38.68 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  40.09 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  40.65 
 
 		 804 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  43.41 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  40 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  39.62 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  39.13 
 
 		 841 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  43.06 
 
 		 804 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  40.29 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  39.32 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  39.32 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  40.1 
 
 		 804 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  39.42 
 
 		 804 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  40.38 
 
 		 801 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  38.86 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  40.49 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  44.25 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  40.1 
 
 		 818 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  38.14 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  39.13 
 
 		 806 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  39.71 
 
 		 813 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  38.21 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  39.71 
 
 		 811 aa  141  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  41.95 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  37.82 
 
 		 217 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  38.54 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  37.31 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  38.83 
 
 		 841 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  37.02 
 
 		 556 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  38.81 
 
 		 807 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.12 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  42.08 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  37.5 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  39.13 
 
 		 802 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  42.08 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  35.71 
 
 		 607 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  39.02 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  40.68 
 
 		 791 aa  131  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  36.62 
 
 		 816 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  37.26 
 
 		 819 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  38.65 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  37.56 
 
 		 803 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  37.14 
 
 		 1181 aa  128  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  33.67 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  36.19 
 
 		 801 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  33.81 
 
 		 254 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  36.11 
 
 		 1154 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  35.71 
 
 		 820 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  33.95 
 
 		 211 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0740  methanol corrinoid protein  36.32 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1063  methanol corrinoid protein  36.32 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  36.87 
 
 		 1176 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  38.98 
 
 		 211 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  36.55 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  37.02 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3637  methanol corrinoid protein  35.71 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  36.02 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  37.97 
 
 		 1226 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  34.72 
 
 		 1154 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  38.5 
 
 		 1266 aa  118  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.84 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  35.92 
 
 		 1193 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  33.82 
 
 		 774 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  36.79 
 
 		 1157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  34.58 
 
 		 1168 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>