More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4872 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 
210 aa  420  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  63.11 
 
 
210 aa  265  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  62.62 
 
 
210 aa  263  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  55.5 
 
 
210 aa  234  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  53.11 
 
 
209 aa  228  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  52.15 
 
 
212 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  50.47 
 
 
213 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  50.75 
 
 
210 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50.24 
 
 
210 aa  197  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  46.41 
 
 
208 aa  190  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  49.74 
 
 
213 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  46.7 
 
 
607 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  49.27 
 
 
326 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  45.37 
 
 
212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  43.41 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  46.23 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  50.72 
 
 
210 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  43.14 
 
 
232 aa  178  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  48.96 
 
 
210 aa  177  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  43.63 
 
 
259 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.29 
 
 
219 aa  174  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.79 
 
 
219 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  42.03 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  46.38 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.29 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  42.29 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  48.74 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  41.46 
 
 
235 aa  171  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  41.79 
 
 
232 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  41.79 
 
 
232 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  46.89 
 
 
221 aa  168  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  45.97 
 
 
209 aa  168  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  46.74 
 
 
217 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  41.51 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  40.8 
 
 
804 aa  161  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  40.58 
 
 
818 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  44.57 
 
 
219 aa  158  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  40.69 
 
 
220 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  46.11 
 
 
208 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  43.52 
 
 
217 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  40.69 
 
 
802 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  47.75 
 
 
214 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  39.61 
 
 
841 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  41.18 
 
 
804 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  40.1 
 
 
841 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  41.08 
 
 
216 aa  148  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  46.02 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  43.02 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.47 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  38.31 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  37.68 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  40.54 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.37 
 
 
211 aa  145  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  37.5 
 
 
800 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  41.38 
 
 
803 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  38.76 
 
 
556 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  38.73 
 
 
804 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  40.69 
 
 
801 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  46.11 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  39.01 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.71 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  41.24 
 
 
217 aa  138  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  37.56 
 
 
804 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  39.51 
 
 
813 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  40 
 
 
811 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  36.87 
 
 
804 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  37.2 
 
 
791 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  35.24 
 
 
839 aa  134  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  41.67 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  42.58 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  36.76 
 
 
820 aa  132  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  41.15 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  37.08 
 
 
220 aa  131  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  39.89 
 
 
217 aa  131  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  35.78 
 
 
804 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  39.36 
 
 
217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  39.69 
 
 
217 aa  128  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  39.69 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  33 
 
 
1136 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  37.07 
 
 
806 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  40.65 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  33.5 
 
 
1136 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  35.41 
 
 
819 aa  124  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  37.7 
 
 
801 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  38.18 
 
 
218 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  38.55 
 
 
213 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  38.68 
 
 
816 aa  121  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  38.71 
 
 
211 aa  121  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  34.65 
 
 
1181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  31.58 
 
 
254 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  32.51 
 
 
1216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  36.47 
 
 
212 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  32.5 
 
 
807 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  34.15 
 
 
216 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.4 
 
 
1163 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  33.01 
 
 
1193 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  30.05 
 
 
768 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  32.97 
 
 
1223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1311  cobalamin B12-binding  34.13 
 
 
221 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.460326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  29.56 
 
 
768 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>