More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2582 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  100 
 
 
213 aa  421  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  62.62 
 
 
212 aa  261  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  64.21 
 
 
210 aa  248  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  59.33 
 
 
209 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  57.08 
 
 
212 aa  244  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  56.6 
 
 
210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  54.76 
 
 
210 aa  225  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  50.97 
 
 
607 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  50.96 
 
 
210 aa  214  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  50.48 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  50.96 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  50.48 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.77 
 
 
326 aa  211  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  48.85 
 
 
232 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  50.24 
 
 
232 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  50.24 
 
 
232 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  50 
 
 
259 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  54.07 
 
 
210 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.85 
 
 
210 aa  208  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  56.32 
 
 
235 aa  208  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  50.95 
 
 
209 aa  205  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  51.27 
 
 
210 aa  205  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  49.76 
 
 
208 aa  205  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  54.3 
 
 
213 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  52.86 
 
 
213 aa  203  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  52.86 
 
 
210 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  45.45 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  47.39 
 
 
224 aa  182  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  41.63 
 
 
218 aa  182  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  44.88 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  47.19 
 
 
556 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  41.04 
 
 
214 aa  168  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.06 
 
 
219 aa  167  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.1 
 
 
219 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.1 
 
 
219 aa  165  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  43.92 
 
 
221 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  40.1 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  46.2 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  42.03 
 
 
841 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  42.72 
 
 
220 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  41.15 
 
 
217 aa  161  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  42.21 
 
 
804 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  43.07 
 
 
217 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  43.39 
 
 
216 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  41.46 
 
 
800 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  44.62 
 
 
219 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  39.05 
 
 
841 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  40.57 
 
 
217 aa  155  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  40.87 
 
 
217 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  39.9 
 
 
804 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.18 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  47.31 
 
 
168 aa  152  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  45.56 
 
 
216 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  38.76 
 
 
213 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  44.32 
 
 
251 aa  148  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  45.45 
 
 
208 aa  147  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  39.2 
 
 
804 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  44.63 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  38.82 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.86 
 
 
216 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  40.35 
 
 
215 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  38.16 
 
 
813 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  40.24 
 
 
218 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  36.71 
 
 
801 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  39.63 
 
 
211 aa  141  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  38.16 
 
 
802 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  40.61 
 
 
212 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  37.2 
 
 
811 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  38.69 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  38.83 
 
 
818 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  35.92 
 
 
839 aa  138  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  40.76 
 
 
207 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  40.22 
 
 
820 aa  138  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  37.06 
 
 
803 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  40.22 
 
 
207 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  34.76 
 
 
819 aa  134  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  33.66 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  38.46 
 
 
1136 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  38.38 
 
 
801 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  35.32 
 
 
804 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  38.34 
 
 
217 aa  131  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  35.5 
 
 
804 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  38.33 
 
 
791 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  35.5 
 
 
804 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  36.28 
 
 
1181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  40.21 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  35.38 
 
 
216 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  37.31 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  36.45 
 
 
1132 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  34.11 
 
 
617 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  33.97 
 
 
806 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  40.88 
 
 
1156 aa  125  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  40.11 
 
 
816 aa  125  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  38.54 
 
 
1136 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  40.12 
 
 
768 aa  125  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  36.87 
 
 
807 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  37.43 
 
 
774 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  34.72 
 
 
217 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  35.61 
 
 
780 aa  123  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  38.86 
 
 
1169 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>