More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1442 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  45.98 
 
 		 804 aa  673    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  43.87 
 
 		 791 aa  644    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  45.62 
 
 		 801 aa  700    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  42.13 
 
 		 819 aa  645    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  43.88 
 
 		 813 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  44.71 
 
 		 804 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  42.74 
 
 		 804 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  46.63 
 
 		 801 aa  723    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  42.86 
 
 		 807 aa  709    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  100 
 
 		 839 aa  1699    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  46.86 
 
 		 800 aa  711    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  46.22 
 
 		 804 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  45.36 
 
 		 806 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  44.3 
 
 		 811 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  40.97 
 
 		 820 aa  597  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  38.33 
 
 		 841 aa  586  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  40.64 
 
 		 804 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  40.71 
 
 		 818 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  40.24 
 
 		 802 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  39.4 
 
 		 803 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  38.99 
 
 		 841 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  39.26 
 
 		 816 aa  534  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  39.6 
 
 		 804 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  36.63 
 
 		 768 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  34.94 
 
 		 768 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.46 
 
 		 774 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  32.38 
 
 		 793 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.43 
 
 		 1132 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.43 
 
 		 1132 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  32.8 
 
 		 1178 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  31.91 
 
 		 1132 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.02 
 
 		 1132 aa  406  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.19 
 
 		 1133 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  31.99 
 
 		 1184 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.91 
 
 		 1132 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  31.83 
 
 		 1132 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.02 
 
 		 1132 aa  406  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.79 
 
 		 1133 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.38 
 
 		 1132 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  30.99 
 
 		 780 aa  401  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  31.57 
 
 		 1215 aa  402  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  31.95 
 
 		 1132 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  32.57 
 
 		 1136 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  32.56 
 
 		 1154 aa  399  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  32.46 
 
 		 1136 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  33.49 
 
 		 1196 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  32.95 
 
 		 1199 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  32.17 
 
 		 1158 aa  388  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  31.52 
 
 		 1158 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  32.05 
 
 		 1169 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  32.21 
 
 		 1154 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  33.9 
 
 		 1150 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  33.83 
 
 		 1150 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  31.96 
 
 		 1189 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  33.71 
 
 		 1150 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  31.4 
 
 		 1156 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  32.64 
 
 		 1236 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  33.3 
 
 		 1149 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  31.68 
 
 		 1191 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  31.79 
 
 		 1191 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  33.29 
 
 		 1193 aa  375  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  31.74 
 
 		 1169 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  31.16 
 
 		 1223 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  31.35 
 
 		 1171 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  32.16 
 
 		 1173 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  30.73 
 
 		 1182 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  31.2 
 
 		 1192 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  32.11 
 
 		 1227 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  31.48 
 
 		 1157 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  31.31 
 
 		 1180 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  31.01 
 
 		 1197 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  30.83 
 
 		 1183 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  31.33 
 
 		 1178 aa  366  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  32.41 
 
 		 1228 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  31.18 
 
 		 1176 aa  365  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  29.58 
 
 		 1191 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 		 1163 aa  365  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  30.73 
 
 		 1182 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  30.62 
 
 		 1241 aa  364  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  30.57 
 
 		 1168 aa  364  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  28.79 
 
 		 1188 aa  363  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  31.32 
 
 		 1167 aa  363  8e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  29.14 
 
 		 1188 aa  363  1e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  31.56 
 
 		 1225 aa  362  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  31.56 
 
 		 1224 aa  362  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  30.88 
 
 		 1249 aa  362  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  31.48 
 
 		 1208 aa  361  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  30.97 
 
 		 1267 aa  361  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  31.01 
 
 		 1171 aa  360  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  32.6 
 
 		 1195 aa  360  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  32.15 
 
 		 1238 aa  360  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  32.31 
 
 		 1266 aa  360  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  30.63 
 
 		 1261 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  30.79 
 
 		 1274 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  31 
 
 		 1250 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  31.38 
 
 		 1244 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  31.49 
 
 		 1244 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  31.28 
 
 		 1264 aa  357  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  31 
 
 		 1232 aa  357  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  31.28 
 
 		 1264 aa  356  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>