More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_08871 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  43.55 
 
 
1223 aa  1009    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  44.79 
 
 
1151 aa  983    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  43.05 
 
 
1181 aa  975    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  41.56 
 
 
1168 aa  945    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  36.83 
 
 
1132 aa  737    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  59.73 
 
 
1191 aa  1457    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  37.23 
 
 
1150 aa  754    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  36.64 
 
 
1132 aa  736    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  36.64 
 
 
1133 aa  737    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  36.64 
 
 
1133 aa  737    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  36.64 
 
 
1132 aa  736    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  44.95 
 
 
1158 aa  1029    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  66.25 
 
 
1182 aa  1600    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  63.71 
 
 
1188 aa  1535    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  37.15 
 
 
1150 aa  752    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  37.09 
 
 
1196 aa  777    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  60.24 
 
 
1178 aa  1457    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  100 
 
 
1191 aa  2454    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  44.36 
 
 
1178 aa  1029    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  61.24 
 
 
1183 aa  1487    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  36.53 
 
 
1132 aa  726    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  62.14 
 
 
1208 aa  1563    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  61.88 
 
 
1208 aa  1575    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  37.01 
 
 
1149 aa  732    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  43.98 
 
 
1192 aa  1003    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  45.79 
 
 
1184 aa  1033    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  36.64 
 
 
1132 aa  736    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.47 
 
 
1163 aa  820    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  63.62 
 
 
1188 aa  1547    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  59.62 
 
 
1190 aa  1484    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  37.31 
 
 
1169 aa  739    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  43.18 
 
 
1182 aa  947    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  44.98 
 
 
1167 aa  1009    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  37.19 
 
 
1150 aa  759    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  58.81 
 
 
1212 aa  1449    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  64.05 
 
 
1214 aa  1590    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  43.47 
 
 
1199 aa  973    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  44.87 
 
 
1157 aa  1028    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  66.22 
 
 
1182 aa  1602    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  44.2 
 
 
1173 aa  988    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  45.55 
 
 
1169 aa  1030    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  43.87 
 
 
1176 aa  996    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  44.57 
 
 
1171 aa  1013    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  36.49 
 
 
1180 aa  768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  62.5 
 
 
1187 aa  1541    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  35.58 
 
 
1208 aa  744    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  59.49 
 
 
1176 aa  1466    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  37.3 
 
 
1136 aa  736    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  42.14 
 
 
1171 aa  951    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  43.56 
 
 
1193 aa  968    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  63.93 
 
 
1188 aa  1543    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  58.64 
 
 
1197 aa  1421    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  57.24 
 
 
1224 aa  1410    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  36.83 
 
 
1132 aa  736    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  44.84 
 
 
1154 aa  1041    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  44.33 
 
 
1215 aa  991    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  36.74 
 
 
1132 aa  740    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  44.82 
 
 
1156 aa  1018    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  35.03 
 
 
1189 aa  702    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  41.89 
 
 
1216 aa  905    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  37.01 
 
 
1132 aa  742    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  37.01 
 
 
1132 aa  736    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  44.16 
 
 
1158 aa  1008    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  46.17 
 
 
1154 aa  1062    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  45.2 
 
 
1195 aa  1005    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  38.65 
 
 
1136 aa  765    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  35.6 
 
 
1254 aa  748    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  41.89 
 
 
1214 aa  924    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  40.32 
 
 
1156 aa  860    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  59.82 
 
 
1191 aa  1461    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  30.59 
 
 
1266 aa  583  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  30.05 
 
 
1236 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.15 
 
 
1226 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  30.65 
 
 
1261 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  30.05 
 
 
1264 aa  555  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  30.14 
 
 
1227 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  30.1 
 
 
1247 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  30.52 
 
 
1226 aa  552  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  29.36 
 
 
1228 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  30.42 
 
 
1226 aa  552  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  30.36 
 
 
1227 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  30.35 
 
 
1243 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  30.39 
 
 
1232 aa  552  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  30.45 
 
 
1227 aa  547  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  30.76 
 
 
1226 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  30.48 
 
 
1227 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  29.59 
 
 
1227 aa  549  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4472  B12-dependent methionine synthase  30.37 
 
 
1227 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.346478 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  30.37 
 
 
1227 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  30.37 
 
 
1227 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  30.07 
 
 
1274 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  30.45 
 
 
1227 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  30.37 
 
 
1227 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  30.37 
 
 
1227 aa  549  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  30.37 
 
 
1227 aa  545  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  30.84 
 
 
1251 aa  546  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  30.71 
 
 
1226 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  29.75 
 
 
1250 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  29.41 
 
 
1228 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  30.62 
 
 
1264 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.509178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>