More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3230 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  48.87 
 
 		 1195 aa  1076    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.1 
 
 		 1132 aa  788    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  41.3 
 
 		 1150 aa  822    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  34.81 
 
 		 1261 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  82.21 
 
 		 1191 aa  2059    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  60.57 
 
 		 1182 aa  1450    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.07 
 
 		 1132 aa  786    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  49.32 
 
 		 1169 aa  1107    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  49.46 
 
 		 1184 aa  1127    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  39.6 
 
 		 1132 aa  776    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.1 
 
 		 1132 aa  787    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.1 
 
 		 1133 aa  789    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.08 
 
 		 1133 aa  789    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  48.41 
 
 		 1199 aa  1081    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  61.15 
 
 		 1191 aa  1477    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  48.35 
 
 		 1158 aa  1091    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  60.4 
 
 		 1182 aa  1445    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  59.5 
 
 		 1187 aa  1437    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  40.27 
 
 		 1136 aa  811    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.98 
 
 		 1132 aa  787    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  71.71 
 
 		 1212 aa  1820    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  78 
 
 		 1178 aa  1912    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  38.91 
 
 		 1254 aa  809    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  40.11 
 
 		 1196 aa  830    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  46.35 
 
 		 1193 aa  1025    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  46.63 
 
 		 1181 aa  1047    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  39.75 
 
 		 1132 aa  786    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  64.62 
 
 		 1208 aa  1589    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  64.68 
 
 		 1208 aa  1607    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  46.1 
 
 		 1215 aa  1033    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.1 
 
 		 1132 aa  787    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  43.48 
 
 		 1163 aa  924    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  60.18 
 
 		 1188 aa  1459    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  71.79 
 
 		 1190 aa  1769    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  100 
 
 		 1183 aa  2452    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  47.8 
 
 		 1182 aa  1043    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  45.42 
 
 		 1171 aa  1010    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  41.16 
 
 		 1150 aa  829    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  45.54 
 
 		 1214 aa  984    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  40 
 
 		 1132 aa  789    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  48.02 
 
 		 1167 aa  1072    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  39.53 
 
 		 1208 aa  818    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  47.24 
 
 		 1156 aa  1060    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  50.43 
 
 		 1154 aa  1129    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  60.57 
 
 		 1188 aa  1448    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  42.13 
 
 		 1156 aa  893    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  48.64 
 
 		 1151 aa  1024    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  41.89 
 
 		 1136 aa  841    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  48.19 
 
 		 1171 aa  1082    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  33.77 
 
 		 1266 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  40.12 
 
 		 1180 aa  832    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  59.9 
 
 		 1188 aa  1449    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  39.48 
 
 		 1169 aa  789    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.97 
 
 		 1132 aa  798    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  48.39 
 
 		 1157 aa  1098    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  78.11 
 
 		 1197 aa  1963    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  67.85 
 
 		 1224 aa  1711    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  46.95 
 
 		 1176 aa  1050    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  48.22 
 
 		 1154 aa  1107    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  47.41 
 
 		 1173 aa  1076    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  82.48 
 
 		 1191 aa  2065    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  49.42 
 
 		 1178 aa  1134    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  77.07 
 
 		 1176 aa  1927    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  39.08 
 
 		 1189 aa  806    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  45.6 
 
 		 1216 aa  981    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  40.62 
 
 		 1149 aa  785    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  48.15 
 
 		 1158 aa  1056    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  48.57 
 
 		 1192 aa  1112    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  46.96 
 
 		 1168 aa  1041    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  41.22 
 
 		 1150 aa  824    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  46.2 
 
 		 1223 aa  1055    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  64.71 
 
 		 1214 aa  1585    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  34.18 
 
 		 1245 aa  630  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  33.49 
 
 		 1274 aa  622  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.84 
 
 		 1226 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  33.8 
 
 		 1228 aa  620  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  32.9 
 
 		 1250 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  33.36 
 
 		 1236 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  33.82 
 
 		 1238 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2467  methionine synthase  33.41 
 
 		 1261 aa  615  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  34.14 
 
 		 1251 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  33.33 
 
 		 1232 aa  612  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  32.78 
 
 		 1226 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  34.04 
 
 		 1264 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  32.54 
 
 		 1226 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  34.37 
 
 		 1226 aa  612  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  33.79 
 
 		 1220 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  33.93 
 
 		 1246 aa  611  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  33.74 
 
 		 1264 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  33.33 
 
 		 1232 aa  612  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  32.7 
 
 		 1230 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  34.11 
 
 		 1246 aa  608  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  33.39 
 
 		 1227 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  33.25 
 
 		 1243 aa  608  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  32.7 
 
 		 1226 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  33.41 
 
 		 1244 aa  609  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  33.55 
 
 		 1244 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  33.99 
 
 		 1245 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  33.63 
 
 		 1257 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  34.47 
 
 		 1293 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>